Παράλληλα με τον μεγάλο αριθμό οστράκων εισηγμένης και ντόπιας κεραμικής, η ανασκαφική έρευνα στο Καραμπουρνάκι έχει φέρει στο φως και πολλά αντικείμενα κατασκευασμένα από λίθο. Από το 1994 έως και το 2016, έχουν καταγραφεί περίπου 350 λίθινα αντικείμενα, που προέρχονται από τις τομές που ανασκάφτηκαν σε όλη την έκταση του αρχαίου οικισμού στην κορυφή της τούμπας. Αν και η μελέτη των αντικειμένων αυτών βρίσκεται σε αρχικό στάδιο, διαφαίνεται ήδη η μεγάλη ποικιλία τους και οι διαφορετικές χρήσεις που πιθανώς είχαν.
Συγκεκριμένα στον οικισμό έχουν βρεθεί λίθινα εργαλεία, τριπτήρες και μυλόπετρες μεγάλου μεγέθους για την επεξεργασία σιτηρών και καρπών, μήτρες για κατασκευή μεταλλικών αντικειμένων, ζωόμορφα ειδώλια, λίθοι με μικρές οπές (ηθμοί;), καθώς και πολλά βότσαλα, τα οποία είναι πιθανό να προέρχονται και από δάπεδα των οικημάτων. Στα λίθινα αντικείμενα συμπεριλαμβάνονται επίσης μεγάλες σχιστολιθικές πλάκες που λειτουργούσαν ως καλύμματα πίθων και που συχνά εντοπίστηκαν in situ. Τα λίθινα υφαντικά βάρη, σφονδύλια και πηνία που ανακαλύφθηκαν στην ανασκαφή αποτελούν μια ξεχωριστή κατηγορία, και μελετώνται ως σύνολο μαζί με τα αντίστοιχα πήλινα. Αν και η χρονολόγηση των λίθινων αντικειμένων είναι λιγότερο ακριβής από αυτήν της κεραμικής, τα αντικείμενα αυτά μπορούν να χρονολογηθούν στους αρχαϊκούς και κλασικούς χρόνους, με βάση τα ανασκαφικά τους συγκείμενα. Τα αντικείμενα αυτά είναι ενδεικτικά κάποιων εργασιών που πιθανώς λάμβαναν χώρο στο Καραμπουρνάκι (επεξεργασία καρπών, ύφανση, παραγωγή μεταλλικών αντικειμένων) και αντικατοπτρίζουν την πολυδιάστατη καθημερινότητα των κατοίκων του οικισμού.
Τριπτήρας κυκλικής διατομής/Driller
